Что мы исследуем
Центральная тема — связь между пространственной структурой и функцией мембранных и мембрано-активных белков и их взаимодействий с лигандами. Значительная часть работ имеет практическую направленность: онкология, нейродегенеративные заболевания, механизмы боли, диагностика.
Основные темы
Мембранные белки и рецепторы
Трансмембранные домены рецепторных тирозинкиназ, toll-подобные рецепторы, рецепторы, сопряжённые с G-белком; гомо- и гетеродимеризация трансмембранных спиралей как механизм передачи сигнала.
Ионные каналы
Натриевые и калиевые каналы: структурная основа проводимости и её модуляции лигандами и токсинами.
Белок-предшественник β-амилоида (APP)
Структура и межмолекулярные взаимодействия APP; нарушение димеризации его трансмембранного домена как фактор развития болезни Альцгеймера.
Нейротоксины
Токсины из ядов змей, насекомых и пауков как модуляторы ионных каналов и рецепторов и как молекулярные инструменты.
Антимикробные и мембрано-активные пептиды
Каналообразующие пептиды и механизмы их действия — например, формирование трансмембранных β-шпилечных димеров как основа антимикробной активности.
Защитные пептиды растений и липид-переносящие белки
Гевеин-подобные пептиды и их взаимодействие с хитином, липид-переносящие белки, ингибиторы протеаз.
Методы и оборудование
Работа опирается на интегральную методологию структурно-динамических исследований, объединяющую ЯМР- и ЭПР-спектроскопию, белковую инженерию и компьютерное моделирование.
Лаборатория оснащена тремя спектрометрами Bruker Avance с рабочими частотами 600, 700 и 800 МГц, снабжёнными криодатчиками; один из приборов позволяет проводить ЯМР твёрдого тела с вращением образца под магическим углом. Развиты собственные системы бактериального и бесклеточного синтеза рекомбинантных белков и получения изотопно-меченых образцов (¹⁵N, ¹³C, ²H), а также мембрано-моделирующие среды для исследования мембранных белков.
Методические разработки включают импульсные последовательности для гетероядерных измерений и программное обеспечение для анализа релаксационных данных биомолекул (программа DASHA). Лаборатория входит в состав центра коллективного пользования ИБХ РАН.